Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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