Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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TTPAP49638 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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TTPAP49638 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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TTPAP49638 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TTPAP49638 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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TTPAP49638 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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TTPAP49638 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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