Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TMPOP42166 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMPOP42166 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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