Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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FAM200BP0CF97 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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FAM200BP0CF97 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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FAM200BP0CF97 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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FAM200BP0CF97 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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FAM200BP0CF97 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM200BP0CF97 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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