Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms