Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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