Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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NDUFA9Q16795 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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NDUFA9Q16795 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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NDUFA9Q16795 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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NDUFA9Q16795 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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