Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 MRRF-202ENST00000344641 9826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ERG-210ENST00000442448 5034 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 OR4D9-202ENST00000641278 6063 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 TLN2-211ENST00000636159 7441 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms