Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms