Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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SYCP1Q15431 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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SYCP1Q15431 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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SYCP1Q15431 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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SYCP1Q15431 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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SYCP1Q15431 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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