Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms