Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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