Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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