Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GRIK2Q13002 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms