Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
TWF1Q12792 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TWF1Q12792 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms