Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC173Q0VFZ6 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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