Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ERVPABLB-1P60509 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms