Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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