Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms