Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MCAMP43121 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MCAMP43121 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms