Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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HOXD10P28358 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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HOXD10P28358 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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HOXD10P28358 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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HOXD10P28358 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
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HOXD10P28358 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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HOXD10P28358 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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