Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 IL31RA-203ENST00000359040 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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