Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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