Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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