Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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CIPCQ9C0C6 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CIPCQ9C0C6 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CIPCQ9C0C6 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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CIPCQ9C0C6 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CIPCQ9C0C6 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CIPCQ9C0C6 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CIPCQ9C0C6 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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CIPCQ9C0C6 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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