Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms