Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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RAB6CQ53S08 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB6CQ53S08 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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