Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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