Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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