Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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