Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms