Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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