Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms