Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms