Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC023509.2-201ENST00000548347 2297 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RBM12B-208ENST00000627241 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ZFAT-207ENST00000520214 4294 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 KLK10-201ENST00000309958 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CFLAR-215ENST00000457277 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ZNF736-201ENST00000355095 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CTPS2-202ENST00000380241 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 SYT17-202ENST00000562034 5092 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 EREG-201ENST00000244869 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RAB37-201ENST00000340415 3804 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 SNORD88A-201ENST00000408314 91 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL354761.1-201ENST00000434190 526 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL096701.1-201ENST00000445477 457 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL365436.1-201ENST00000452587 495 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RN7SL856P-201ENST00000461754 298 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 YWHAQP6-201ENST00000508556 304 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC127029.1-201ENST00000560822 237 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RN7SL731P-201ENST00000584329 293 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 BOD1P1-201ENST00000584421 436 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC093107.2-201ENST00000603668 445 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 MIR7113-201ENST00000621222 59 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 DZIP1-202ENST00000361156 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 TCF4-226ENST00000565018 2357 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AK2-202ENST00000373449 3586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 GFM2-207ENST00000509430 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 HPCAL4-203ENST00000617690 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 GNA12-202ENST00000407653 3785 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 BTN3A2-204ENST00000396948 1494 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 KCTD7-207ENST00000639879 5098 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ZAN-205ENST00000613979 8669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 PSD4-205ENST00000441564 11234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 SFXN2-201ENST00000369893 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC091013.1-201ENST00000499752 3734 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 NRIP1-202ENST00000400199 7562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 IKBKB-202ENST00000416505 4036 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 TCTN2-201ENST00000303372 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 PCDHGB6-202ENST00000616430 4601 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 SPIN3-205ENST00000638289 4614 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 EYA1-206ENST00000388743 2199 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL513523.1-201ENST00000417868 1309 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 NAIP-201ENST00000194097 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 KCNMA1-240ENST00000638575 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 KCNMA1-245ENST00000638759 3723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ALS2-206ENST00000467448 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC004264.2-201ENST00000623328 1737 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ERMARD-204ENST00000392095 1908 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 PPARD-201ENST00000311565 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 MED22-208ENST00000610672 4367 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 LINC00608-202ENST00000432733 2818 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 SIM1-202ENST00000369208 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RGMA-201ENST00000329082 11350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ACSBG1-201ENST00000258873 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 LCN2-202ENST00000372998 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 MIR646-201ENST00000385067 94 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL117378.1-202ENST00000421310 601 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL391987.3-201ENST00000441101 719 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC117422.1-201ENST00000508263 379 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC025437.6-201ENST00000518624 935 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 IGHV3-50-201ENST00000522107 317 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RN7SL670P-201ENST00000577235 294 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RBM22P6-201ENST00000611682 867 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CPSF7-226ENST00000626926 306 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
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