Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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