Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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