Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRIG3Q6UXM1 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms