Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms