Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms