Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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