Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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TCOF1Q13428 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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TCOF1Q13428 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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TCOF1Q13428 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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