Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SNX18P27-201ENST00000523611 779 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC079598.4-201ENST00000549647 265 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL391903.2-201ENST00000614532 247 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC233702.2-201ENST00000618784 583 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 METTL2A-204ENST00000616852 3150 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC024132.1-201ENST00000382007 2509 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PARP1P1-201ENST00000413631 3026 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 DPH6-202ENST00000440392 3648 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ZNF334-201ENST00000347606 3890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SOX6-210ENST00000528252 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PALM2-AKAP2-201ENST00000302798 4718 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 FAM13C-215ENST00000614220 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC01132-201ENST00000437601 3793 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 GPR19-201ENST00000332427 1743 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 OR2T6-201ENST00000355728 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC009988.1-201ENST00000434988 310 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC021001.1-201ENST00000518703 987 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AP004833.3-201ENST00000531893 322 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC079313.2-201ENST00000550474 564 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RN7SL715P-201ENST00000606972 286 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC129908.1-201ENST00000624553 648 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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