Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
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