Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC008496.2-201ENST00000421252 460 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AJ006995.1-201ENST00000433344 572 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ABRACL-202ENST00000461027 456 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC068898.2-201ENST00000514425 597 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MT1L-202ENST00000566367 78 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC010761.2-202ENST00000582536 391 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CYFIP2-210ENST00000522463 3477 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LINC01358-207ENST00000634502 2575 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 Z97200.1-201ENST00000606154 2045 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 BCAS1-202ENST00000395961 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 EPN2-204ENST00000395620 3860 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 TARS-201ENST00000265112 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 BTBD3-214ENST00000618296 4582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SELP-202ENST00000367786 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RGS7-202ENST00000366563 2206 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CCDC149-204ENST00000504487 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 DNAH10-209ENST00000614082 3484 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SPX-201ENST00000256969 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CHD7-203ENST00000525508 4777 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LGALS8-202ENST00000323938 1855 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ZNF92-202ENST00000357512 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 FCGR3B-202ENST00000367964 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RBMY2GP-201ENST00000418671 1034 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 GAPDHP73-201ENST00000423411 1007 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC003071.2-201ENST00000423857 315 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RBMY2NP-201ENST00000434454 1028 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL590490.1-201ENST00000455599 316 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC005154.1-225ENST00000581665 564 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RPS28P1-201ENST00000604589 187 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MIAT_exon5_1.1-201ENST00000618919 149 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 TLR1-202ENST00000502213 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC022784.6-204ENST00000520390 3442 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 GIN1-201ENST00000399004 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms