Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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