Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms