Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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