Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TTPAP49638 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TTPAP49638 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TTPAP49638 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TTPAP49638 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TTPAP49638 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TTPAP49638 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TTPAP49638 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms