Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms